虽然番茄富含多种营养成分，但人们最看重的莫过于番茄红素了，番茄红素具有特别的抗氧化能力，能清除自由基。
番茄颜色越红番茄红素越多。番茄品种、颜色、成熟度、甜度，甚至生产季节的不同，都是决定其中番茄红素含量的重要原因。黄色品种的西红柿中番茄红素含量很少，每100克仅含0.3毫克；红色品种的番茄则含量较高，一般每100克含2~3毫克，最高能达到20毫克。一般来说，番茄颜色越红，番茄红素含量越高，市场上还有一种粉红色的番茄，番茄红素的含量也不如红色的高。
番茄越不甜番茄红素含量越高。番茄红素的含量与番茄中可溶性糖的含量是负相关的关系，也就是说，越是不甜的西红柿，其中番茄红素含量越高。此外，夏天生产的番茄中番茄红素含量比较高，这主要是因为夏天阳光充沛、光照时间长，会让番茄红素的含量大大增加；而冬天温室大棚里种植的番茄，番茄红素的含量比较低。
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