国家“863计划”现代农业技术领域通过攻关在主要海水养殖生物的BLUP育种技术体系取得重要突破，鱼类、贝类水产动物多性状复合育种技术达到世界领先水平。
打破了国外水产发达国家的技术垄断和封锁，率先建立了我国自主知识产权的水产生物BLUP育种体系。研发了“水产动物育种分析与管理系统”和“贝类育种评估和分析系统”，实现了从良种选育、良种推广到系谱追溯等所有环节的标准化和电子化管理，可自动完成种质和性能测定数据的管理、遗传参数估算、育种值计算、配种方案制定等技术工作。
应用分子育种技术、细胞工程技术结合BLUP家系选育技术大大加快了鲆鲽鱼类的育种进程，保障了海水鱼养殖业的健康可持续发展。应用BLUP育种技术建立了鲆鲽鱼的现代育种体系，完成了鲆鲽鱼不同生长阶段的遗传参数测定工作，提出了3种育种模式，有效地指导了鲆鲽鱼良种的快速选育工作，选育品系的生长性状和抗逆性状改良显著，生长速率比对照提高21%，成活率达到60%，比国际先进水平（17%成活率）提高了33%以上。
开发了基于BLUP及REML法的选种选配和育种参数估计软件--贝类遗传育种分析评估系统，这是国际上首次在贝类育种建成这一技术系统，使我国贝类育种技术水平得到极大的提高；在分子标记育种方面走在国际前列，开发的栉孔扇贝的微卫星标记占国际已发表总数的90%以上，完成了栉孔扇贝第一代SSR遗传连锁图谱的构建，是目前国际上两个完全以SSR为标记的贝类遗传图谱之一，位点数目比美国最近发表的牡蛎SSR标记图谱的位点多一倍。
