9月，有报道称，汇源透过厂房所处的水果购销中心或水果行作为中间人，向果农大量购买瞎果（即由于各种原因腐烂变质、或未成熟之前就跌落的水果），再用来制成果汁或浓缩果汁。对此说法，汇源集团党委书记赵金林直呼"委屈"。
赵金林：报道出来，你自己都说你没进过工厂，怎么会产生汇源用烂果子做果汁的报道呢？我们觉得很委屈，国家局当天就来抽检了，而且我们为了慎重起见，自己把大箱样品拿到北京去送检。记者问我说，你们都送检，结果出来会怎么样，我说我可以肯定地讲，结果出来肯定是符合要求的，检测还没出来前，我们可以拍着胸脯说没问题，有问题企业要承担一切责任。
汇源介绍，进入公司生产线的水果，需经历进厂检验称重、二道清洗、二道喷淋、分拣筛选多个流程，每个流程有多人把关，确保质量合格。汇源生产中心品控总监姜建森解释道。
姜建森：原料验收至少有三道把关，采购的时候有我们现场监督装车，进厂以后有专门抽检，严格控制腐烂果比率。卸果的过程中任何的夹杂都会及时制止。然后进入车间的清洗工作。一道洗果池洗完后有强力的高压喷淋冲洗，高压喷淋冲洗以后就是拣果台，每条线至少配置6个人，所有的腐烂不良都会挑出来，保证继续运行的没有腐烂果。
国家食品药品监督管理总局食监一司副巡视员陈传意表示，在监管部门抽检中，汇源果汁各项指标均合格。
陈传意：如果涉嫌用瞎果生产果汁，它的棒曲霉素一定超标。经检验，结果合格。
