目前国际上对转基因食品的管理大体可分为美国和欧盟两种模式：美国政府对转基因食品的管理相对宽松；欧盟则要严格、复杂得多。双方的分歧主要在于：欧洲国家认为，只要不能否定转基因食品的危险性，就应该加以限制。而美国则主张，只要在科学上无法证明它有危险性，就不应该限制。
美国政府参与转基因植物及其产品的管理已有l2年的历史。美国农业部动植物健康检验局(USDA-APEIS)负责管理转基因植物的开发和田间试验；美国环保局负责对转基因植物的环境影响进行评估；而食品与药品管理局(FDA)则负责转基因食品和饲料的安全性评估。例如，2001年之前，FDA虽然要求开发商提供转基因食品安全性的详细资料，但不是强制性的。2001年1月17日之后，FDA对上述转基因食品管理过程转为强制性，要求开发商在转基因食品进入市场之前至少120天，向FDA提出申请并提供此类食品的相关研究资料，以确认此类食品与相应的传统产品具有同等的安全性。
为加强对转基因作物的管理，美国白宫科技政策办公室最近又提出了一项新建议。根据该建议，即使是在风险还不明显的小规模种植阶段，投入田间试验的转基因作物也需接受FDA、EPA等部门的安全性评估。与美国现有的转基因作物田间试验管理措施相比，新建议在尺度上更为严格，主要体现在对田间试验进行安全性检测的时间有所提前。
总的来说，美国对转基因食品的管理是较为宽松的。在美国，一种转基因食品从申报到批准一般只需要5个月的时间，而在欧盟则通常至少需要l7个月。
