公众的质疑主要基于转基因食品的安全性，网上检索转基因食品词条，其负面消息海量充斥。以国内为例，抗棉铃虫的转基因棉花是最大的商业化种植的转基因农作物，虽然从１９８７年开始推广种植，但到现在疑虑也没有完全消除。尤其是去年底，华中农业大学的转抗虫基因水稻被国家授予安全证书，以致在国内掀起一场保护中国口粮安全性的网络运动。
而与此同时，赞成转基因食品的科学家则呼吁公众要接受转基因食品，对转基因技术持认可态度。科学家认为，转基因食品的安全评价手段与程序日趋成熟，并且新一代的转基因食品将不断上市，会更大程度地造福人类。
就拿笔者１２月１日参加的“农业生物技术与食品安全”研讨会来说，更像是生物工程专家的布道，试图说服与会者，转基因食品的安全可靠。他们的依据是：对于转基因作物和产品，中国以严格的科学评价为基础，并且依法实施规范管理；转基因作物要经过广泛的化学、毒理学、致敏学、营养学方面的评估，要经过比任何传统食品都更为严格、苛刻的安全性评价。与会的科学家认为，目前中国所采用的食品安全评价方法已经是当前全球最严格、最全面的方法。因此，凡是批准上市的转基因食品都是安全的。
笔者以为，面对专业技术领域，任何的盲从和盲目都要不得。笔者并非对转基因食品持否定态度，而是认为对其一定要持审慎态度。即使对那些激烈反对转基因食品的公众也要说一声：情绪化的排斥更不是应有的基本态度。
反对者言之凿凿：凡是对转基因食品认可的，都是被一些生物技术公司所收买，因为背后有强大的商业利益。笔者想告诫反对者，那些反对农业生物技术的国际组织，其背后依然有不易被觉察的商业交易。看似简单的纯技术问题，往往隐藏着巨大的经济利益、政治博弈以及国际贸易等因素。只是，社会公众总是被对立双方所裹挟。
笔者理解反对者，没有足够的时间跨度很难证明转基因食品的技术手段是安全的。但当下国内的农业生物技术又被另一种声音干扰：跨国公司掌握着全球最多的转基因生物技术的知识产权，从而派生出垄断和安全问题，但因此怀疑甚至拒绝转基因生物技术实属因噎废食，这也不利于国内农业生物技术的发展。
应该看到，发展以基因工程为代表的生物技术已上升为国家战略，农业生物技术不仅在解决“三农”问题、实现传统农业向现代农业跨越中将发挥重大作用，而且将成为解决食品安全、环境保护、能源短缺等重大社会与经济问题的有效手段。
鉴于公众的审慎态度，国家则应提高对转基因食品的透明度，对转基因农作物的食品安全性和环境安全性严格审核，并对转基因食品的标识进行严格监督，并引导公众以理性科学的态度面对农业生物技术。
