牛奶中还有一种非常不稳定的磷酸盐，加热时会形成沉淀物。当牛奶加热至100℃左右进，同时还会生成少量的甲酸，使牛奶带有酸味。最好的煮沸方法是采用“巴氏消毒法“：把牛奶加温至61.1至62.8℃之间半小时，或加温至71.7℃时15至30分钟，这样就可以把细菌杀死。如无法控制以上湿度，也可将牛奶烧开2至3分钟，但千万不能过长时间煮沸。
有些母亲认为牛奶煮的时间越长越好，这样有利于消毒杀菌。殊不知，这样做是完全错误的。牛奶中含有丰富的蛋白质，加热时呈液态的蛋白质微粒会发生很大变化。当牛奶到60至62℃时，就会出现轻微的脱水现象，蛋白微粒由溶液状态变为凝胶状态，并可出现沉淀。
