这份由海关总署综合统计司发布的分析报告显示，2005年国内食品供给能力有了明显提升，国内传统大宗原料食品如水海产品、谷物及谷物粉、蔬菜和鲜、干水果及坚果等在国际市场上具有一定的竞争优势，出口实现不同程度的增长。其中水海产品出口43.5亿美元，增长7.3%，占当年我国食品出口总值的18%；蔬菜出口33亿美元，增长18.7%；谷物及谷物粉出口15.2亿美元，增长83.5％；鲜、干水果及坚果出口9亿美元，增长17.3%。这表明，国内食品的生产加工能力明显提高，食品生产技术和产品结构得到进一步优化，但与此同时，分析报告也指出，仍有一些问题值得关注：
食品安全问题——我国食品出口的硬伤。分析报告认为，近年来发生的苏丹红、孔雀石绿、劣质奶粉、陈化粮等食品安全问题，不仅了影响国内居民的日常生活，也制约了国外市场对我国食品的进口需求。如2005年6月发生的“孔雀石绿”药残事件，由此引发药残事件使我国烤鳗出口严重受阻。虽然我国早在2002年5月就将孔雀石绿列入《食品动物禁用的兽药及其化合物清单》中，但由于孔雀石绿价格便宜且治疗水霉病等功效明显，部分养殖者在水产养殖过程中仍偷偷使用。2005年我国出口烤鳗仅4.2万吨，下降幅度达到30.3％。
反倾销——我国食品出口的绊脚石。报告指出，在我国连续11年成为全球遭受反倾销调查最多的国家的背景下，食品行业不可能“独善其身”。2005年1月，美国裁定除湛江国联获得零关税外，其他虾产品企业对美出口存在倾销行为，被征收27.9％到112.8％不等的反倾销税，使我国对虾产品出口严重受阻。另外，我国的蘑菇罐头分别被美国、欧盟采取征收反倾销税和实行关税配额限制措施，对美、欧的出口值分别下降了11.5%和7.4%；2005年4月、5月，澳大利亚和墨西哥也相继对原产于中国的蘑菇罐头进行反倾销调查。
“绿色壁垒”——我国食品出口的瓶颈。加入WTO之后，虽然关税壁垒等贸易保护措施逐步取消，但部分发达国家为保护国内产业不受冲击，频频利用自身经济优势设立的各种“绿色壁垒”限制外来产品的进入。如欧盟从2005年8月起，对硫丹（具有杀螨作用的有机广谱杀虫剂）在茶叶中的残留限量从30毫克/公斤调整为0.01毫克/公斤，导致2005年我国茶叶对欧盟出口茶叶仅1.6万吨，下降24.2％。报告指出，特别值得注意的是，从2006年1月1日欧盟开始实施新的《欧盟食品及饲料安全管理法规》，特别要求进口食品必须符合新食品安全法的标准，否则不准进入欧盟市场。日本在2006年5月份正式施行的《食品中残留农业化学品肯定列表制度》，针对进口食品、农产品中可能出现的734种农药、兽药和饲料添加剂，明确设定了近5万个暂定标准。比如将茶叶农残限量指标增至276（种）类，检测办法也更为苛刻，部分项目将“茶汤检测法”改为“全茶溶剂检测法”，大幅提高了市场准入门槛。这一系列“绿色壁垒”使我国食品走出“国门”的难度不断加大。
国内食品安全体系——我国食品出口的软肋。报告认为，国内目前缺乏有效的统一协调机制，这使我国食品安全问题面临着比较严峻的局面。特别是我国食品相关标准由国家标准、行业标准、地方标准、企业标准等4级构成，标准之间的矛盾问题突出，并且实施的食品质量认证标准体系并未完全同国际标准相接轨，使通过国内质量检查和安全认证的出口食品常常止步于国外的“绿色壁垒”。据悉，尽管2005年我国出口因质量问题遭遇退运的食品价值比2004年下降22.9％，但仍然高达6246万美元。
市场开放——我国食品行业的隐痛。根据入世后农业协议的规定，我国农产品关税水平从2001年的19.9％降至2005年的15.3％，2006年关税税率进一步下调至15.2％，进口配额、许可证等贸易限制措施逐步弱化和取消，导致国际市场上大量廉价的食品涌入国内市场，对国内食品行业的长期发展的冲击不容忽视。报告指出，东盟现已成为我国进口水果最大的“果园”，特别是东盟的热带水果成本低、品质好，且成熟期略早于我国，市场竞争优势明显。进口的水果不仅对广东、广西、云南、福建等省区的水果种植户造成巨大压力，同时也挤占了国产热带、亚热带水果的市场份额。
