在刚刚闭幕的第三届中国百名医学家峰会上，国家新药及保健食品评审委员会委员、中国工程院李连达院士指出，当前我国保健食品行业存在五大问题。
一是“三小”：小企业、小产品、小市场。全国有1000多家保健食品生产企业，投资过亿元的企业不超过5%，都是一些小企业。年产值超过1亿元的产品也不到5%，小企业、小产品构成了小市场，因此在市场上竞争不过进口产品，走向国际市场更是缺乏竞争力。
二是“三低”：低投入、低水平、低质量。研究一个新药的投入大约是3亿-5亿美元，而我国研究一个保健食品的投入大概是30万-50万元人民币，这么低的投入不可能出高科技产品，投入太低水平就很低，质量也很低。
三是种类多、寿命短。市场上有上千种保健食品，但是能长销的不多。今后的发展方向应该是产品品种要少一些，市场寿命要长一些，也就是发展科技含量高、真正安全有效的好产品。
四是虚假广告严重，特别是前些年媒体上大量出现保健食品的虚假广告，夸大其词甚至无中生有，编造一些所谓的新科学、新名词、新理论，实际上属于伪科学。近年来主管部门加大了打击力度，经过整顿打击市场秩序有了明显好转，但效果还不理想。保健食品虚假广告也是这种情况，今后应该进一步加大整顿虚假广告的力度。
五是有些减肥保健食品违法添加化学成分。在保健食品中添加化学成分属于违法行为。但在减肥保健食品经常出现这个问题，生产商在产品里添加化学成分，希望能够速效减肥，但这对人体的危害很大。
针对这五大问题，李连达认为，我国保健食品行业应该加强科研工作，提高科研水平，提高保健食品的科技含量；加强市场管理，一方面企业要自律，另一方面群众要监督举报。此外，建议企业树立大企业、大品牌、大市场观念，这也是今后的发展方向。
