目前各地对食品安全管理的职能部门有药监、农业、质监、卫生、工商及商务局等多个部门，它们分别监管食用农产品生产、食品安全标准制定、食品生产卫生状况、食品企业无照经营和生猪屠宰管理，此外城管部门负责查处街边游摊；出入境检验检疫局负责进出口食品检验检疫；教委负责学校食品安全；建委负责建筑工地食品安全……然而，老百姓遇到涉及到食品安全问题的事件却不知向哪个部门投诉，不知如何维权。多头管理、齐抓共管到头来往往是没人管，也管不好。
超市散装食品存隐患
超市的自制食品区，大部分食品是在卖场以外的地区加工，消费者只能看到成品，无法看到熟食的制作过程，也无从得知那些自制品的保质期、生产日期、成分以及原料，食品的质量无法得到保障。部分超市中现场制作的食品堆放在敞开的柜台上、木桶里，没有遮盖,价签上也没有食品的生产期、保质期的标注和禁止触摸的标志。有的消费者在挑选商品时，甚至将已经拿到手里的食品再放回去，还有不戴口罩的售货员对着食品互相聊天。
早市夜市监管有盲点
早市往往是许多家庭主妇和餐馆采购食品原料的首选，城市里大大小小的夜市已经成了日常休闲场所，但目前早市夜市都存在食品安全监管盲点。比如小食品及各类饼干、香油很多都没有出厂日期、厂址和生产厂家。另外，农村私自屠宰的鸡、鸭、鹅等几乎都没有进行卫生检疫。应该成立一个专门对早、夜市场内的经营者进行监管的管理机构，按照相关法律法规对早、夜市进行监管，为避免交叉污染，同一区域的食品摊位设置要按照生熟分开的原则，合理划定功能区域，分类设置摊位，并在不同区域作明显标识，为市民提供一个放心选购的良好环境。
现有食品检验信息难共享
这两年政府为保障食品安全投入资金不少，但资源未能合理利用。各地食品安全检验资源多数还处于分散闲置状态，常常是多个部门各自都花钱购置了设备，但不能很好利用，甚至有时检测的标准会不一样；食品安全检验监测缺少信息共享系统，无法实现检验监测体系内各部门互通信息。所以应充分调动现有的卫生防疫、质检、农牧等部门的食品安全检验资源，分区域、分行业进行科学整合分工，为食品安全监管提供科学依据。
