三鹿奶粉事件发生后，农业部认真贯彻落实党中央、国务院的部署和要求，高度重视，迅速行动，全力以赴抓好奶站整顿、奶业扶持和饲料行业整治这三件大事。自9月22日启动全国奶站清理整顿行动以来，农业部先后2次召开全国视频会议，连续9次发出紧急通知，分两批共派出14个工作组赴奶业主产省区迅速开展督导工作。农业部党组强调，要按照中央提出的学习实践与推动工作两不误、两促进的要求，把抓好三件大事作为深入学习实践科学发展观活动的主题实践活动之一。
据了解，三鹿奶粉事件发生后，农业部第一时间成立了应急响应工作组，建立了每日会商和日报制度，集中力量，周密部署，全力投入事件应对工作。9月22日，农业部会同工业和信息化部、公安部、卫生部、工商总局、质检总局等部门，正式启动了为期一个月的奶站清理整顿行动。通过这次联合整治行动，逐一排查，严厉打击，坚决杜绝在生鲜奶中添加三聚氰胺等违法行为；将所有奶站纳入监管范围，规范行为，着力研究构建奶站监管的长效机制。农业部部长孙政才要求，各级农业和畜牧兽医部门要以最坚决的态度、最扎实的作风、最严格的纪律、最有力的措施，切实抓好整治行动，确保奶业健康发展。
从农业部督导组反映的情况看，各省(区、市)政府高度重视，各级农业和畜牧兽医部门行动迅速，工作扎实有效。迅速研判事态形势，明确应对工作重点；强化责任，加强协调；维护奶农利益，保护产业基础；迅速行动，严厉打击不法行为。已有14个省(区、市)出台了稳定奶业生产扶持政策，截至10月6日，各地已派出27.3万人次参加奶站整顿和饲料专项整治行动。对20393个奶站进行了监督检查，做到了逐一登记、一站一表。目前，各地倒奶现象得到缓解，由9月22日倒奶比例最高的23.6%下降到10月5日的4.1%，下降了19.5个百分点。
10月6日，国务院常务会议审议并原则通过《乳品质量安全监督管理条例(草案)》，10月7日，农业部召开专题会议，传达学习国务院常务会议精神，并研究部署贯彻落实工作。孙政才强调，当前奶粉事件应急处理工作还处于关键时刻，全面清理整顿奶站、扶持奶业、加强饲料质量监管工作任务十分艰巨，要坚持立足当前、着眼长远，突出重点、统筹推进，落实责任、加强协调，强化监管、加强执法，全面完成奶业整顿和振兴各项任务。要加快制定贯彻落实《纲要》和《条例》的配套文件和工作方案；要继续全力推进奶站整顿、奶业扶持和饲料整治各项工作，确保如期完成各项任务，力争在年底前实现奶业生产恢复正常；要突出抓好关键环节，着力推进全面提高奶畜饲养以及生鲜奶生产环节、收购环节的监督管理水平；要抓紧制定和实施全国奶业发展规划，全面提高奶业发展水平，逐步实现振兴奶业各项目标。
孙政才指出，各级农业和畜牧兽医部门一定要认清形势、正视问题、坚定信心，坚决按照党中央、国务院的部署和要求，继续深入地抓好奶站整顿、奶业扶持和饲料整治各项工作。
一要切实强化政策落实和技术服务指导。在加快落实已有扶持政策基础上，切实加大政策扶持力度和生产救助力度。强化对养殖场户科学安全配制饲料的指导，加强技术培训和生产服务，加强奶牛疫病防控。
二要不折不扣地完成奶站清理整顿各项任务。10月5日前完成奶站登记造册，将奶站100%纳入监管范围，规范奶站资质和条件。推行鲜奶流通封闭运行的经验，加强对生鲜奶质量的抽查，严厉打击违法添加三聚氰胺等有毒有害物质以及各种掺杂使假的违法行为，严厉打击弄虚作假、坑农害农的违法奶站，确保生鲜奶质量安全。
三要坚决深入地开展饲料质量安全整治行动。对饲料生产企业进行全覆盖监督检查，一家不漏查资质，一家不漏查执照，坚决取缔“三无”饲料生产企业。对各种蛋白饲料原料、饲料产品进行全面抽检，发现在饲料中违法添加三聚氰胺等有害化学物质的，坚决查封并进行无害化处理，对企业一律依法吊销饲料生产许可证。加大执法力度，对大案要案坚决查处，对不法分子要形成强大震慑力。
四要尽快制定饲料中三聚氰胺残留限量行业标准。要综合考虑饲料中三聚氰胺残留背景值、对动物及动物产品安全的影响等因素，以科学的态度拿出翔实的、有说服力的数据，借鉴国外做法，与有关食品标准作好衔接，制定饲料中三聚氰胺残留限量行业标准。要加大抗生素使用和滥用药物监管力度。
五要继续加强工作督导和宣传引导。加大督导工作力度，推动各地不折不扣地落实工作部署。及时总结推广各地好经验、好做法，推动各地尽快出台奶农扶持政策。
