让人担忧的是，如果在养殖业滥用抗生素，不仅会给动物性食品的安全带来潜在隐患，也会对人类的健康及生存环境造成危害。因此，对动物合理使用抗生素已经成为食品安全和畜牧业健康发展中一个不容忽视的问题。
在我国，兽用抗生素在兽医临床和动物饲养方面应用广泛、不可或缺，但是，在使用过程中也存在一些不容忽视的问题，比如盲目随意用药、长期过量使用等情况在少数地区比较突出，使用禁用抗菌素的现象也时有发生。如何合理使用抗生素，保障我们食用的禽蛋奶肉等食品的安全成为关注焦点。
中国农业大学教授何伟勇：销售过程的监督还有一个很重要的环节，就是我们的产品出来之后，不管是蛋、鸡、猪肉，上市之前的监督。没有强硬的监督标准，没有强硬的完善的监督机制和机构，基层诊断水平的缺失和基层诊断设备的缺失也给我们药物的使用带来一些漏洞。耐药性的解决这个问题，除了我们经常去做监测之外，更重要的是把外围服务的硬件和我们对基层服务素质的再提高，把这些问题补上。不能说简单限制它的用药，或者是不让他用药，把思想给他打通，我觉得这个更容易解决我们现在这个问题。
其实，不仅在中国，世界上很多国家也面临着相同的问题，也在不断探索解决方案。比如美国纽约曼哈顿联邦法院法官近日就作出判决，禁止在动物饲料中使用常用抗生素。判决称，如果抗生素的生产商不能证明其产品的安全性，就必须收回这些药物非治疗用途的使用许可。法官指出，过度使用抗生素会催生拥有抗药性的“超级细菌”，危害人类健康。在动物用抗生素的管理上，不少国家的做法值得借鉴。中国农业大学教授吴聪明：
吴聪明：像欧盟它的管理那么好，它抗药性问题也是一个非常严重的问题，因为现在来说拿2006年它全部进入抗生促进剂，但是它的抗药性还在上升，但是它有一套比较完整系统的监控，一般新药如果它上市之前就发现它有5%的耐药率，他就认为这个新药是不宜在社会上使用。
何伟勇：日本的抗生素出来的时候，谁生产的？卖给谁？有没有处方？用了以后有什么反应？它是一连串的一套监督。不是一个环节的问题，它是一连串的一个循环。
不少专家呼吁要加强基层兽医队伍的建设。据了解，目前我国兽医教育与发达国家的差距巨大，基层兽医严重匮乏，得不到科学、专业的指导，是目前少数地区出现滥用药物的重要原因。中国兽医协会秘书长才学鹏谈到自己的基层调研经历，呼吁尽快提高基层兽医水平：
才学鹏：一个市的标准化建设点，这一个兽医站23个人，有一个有执业兽医资格，有一个是职业助理兽医资格，其余我跑了这么多基层兽医站，从来没有遇见过一个通过考试的。就是说现在我们要想提高基层防疫人员的水平任重而道远。
专家表示，在动物诊疗和养殖环节滥用抗生素的问题绝不是哪一个部门能够解决的，必须从抗菌素生产源头加以管理，在提高抗菌素的产品质量、完善执业兽医制度、强化兽药分类和监管制度等等方面齐抓共管，才能尽可能遏制抗生素滥用问题，保障我们的食品安全。
