《方案》要求突出抓好农村食品安全。进一步加强农村地区食品生产加工、流通和消费等各个环节的监管，突出抓好对分散在广大农村的各类食品批发市场、集贸市场、个体商贩、小作坊、小商店、小餐馆和学校食堂等的整治，有效遏制假冒伪劣食品进入农村市场。进一步推进农村食品安全流通网、监管责任网和群众监督网建设。推进“万村千乡市场工程”。建立农村专兼职食品安全管理队伍，填补监管空白。
《方案》要求，狠抓农产品污染源头治理，深入推进“无公害食品行动计划”，强化农产品质量安全例行监测，深入开展对农业生产环境、投入品、生产过程的治理。强化食品生产加工监管，严格对食品的质量安全进行监管。
《方案》强调，进一步整治和规范食品流通环节经营秩序。严格食品经营主体市场准入，严把食品生产经营主体准入关，始终坚持先证后照，坚决依法取缔无照经营；对涉及食品生产、销售的企业和个体工商户的经营资格进行全面清理，主要内容包括证照是否齐全有效、经营事项与登记事项是否一致、年检和验照是否通过等。加强市场食品质量监管，建立健全食品质量准入体系，逐步扩大对食品的日常监测和快速检测的覆盖面，配备食品快速检测设备，完善食品安全监测数据直报点制度；加大食品市场日常监管力度，开展重点区域和节日食品市场等专项执法检查，依法查办食品违法案件；加强对食品退市的监管。继续推进“三绿”工程，确保上市销售食品的渠道正、品质好、手续全；加强对生猪屠宰行为的监管，对全国屠宰企业进行清理整顿；开展酒类市场专项整治。
