惠泉啤酒首当其冲的问题是公司董事长未能勤勉尽职，2011年1月至今年7月31日，公司召开四次股东大会，其中两次股东大会董事长既未主持也未出席，但却没有任何说明和委托书；而在同时间段内，董事长出席的两次，在没有主持会议的情况下，信披却堂而皇之地披露会议主持人为董事长。
同时，公司在超额任命一位副总经理的情况下，在监事审计部和内审部却未配备专职工作人员。
惠泉啤酒2010年和2011年年报披露，“报道期内公司全体董事、监事、高级管理人员领取的税前报酬总额”分别为152.19万元、177万元、78万元。
证监局经过调查，2009年高管仅年终奖就高达686.91万元，2010年高管也拿到了349.21万元的年终奖。而且高管的年终奖也未计入当期费用，违反了《企业会计准则-职工薪酬》的规定。
另外，公司委托理财超限额未及时披露，2011年度利用不超过2亿元自有资金购买银行短期理财产品。截至2011年底，公司累计委托理财金额为4亿元，超过相关规定限额未公告。在财务核算方面，公司将广告促销品、广告费以及咨询费的会计处理也有违规的情况发生。
市场关注最多的公司同业竞争问题仍没有改观。公司与控股股东燕京啤酒同属啤酒生产企业，存在同业竞争。为解决同业竞争问题，公司控股股东在2003年和2006年分别出具承诺避免同业竞争。检查发现，公司与控股股东的同业竞争问题并未得到彻底解决，公司与控股股东在多个省份存在同业竞争，并对公司业绩产生一定影响。
在众多上市啤酒公司中，惠泉啤酒是极个别中期业绩亏损的公司，惠泉啤酒今年上半年净利润亏损2567万元。
