番茄枯萎病病菌能在土壤中残留，由土壤传播。侵入植株后，下部叶片开始变黄，病情发展后上部叶也枯黄，有时仅一侧叶片变黄。切开病株的茎，可见导管变褐色。一旦发病，难以防治，选用抗病品种、实行３年以上轮作很重要。根腐枯萎是大棚番茄遇低温时发生枯萎病的症状，病株茎导管中的褐变不向上发展，根部腐烂重。病株茎中空，一般从植株顶部向下枯萎。大棚内连作番茄，使病菌积累，低温时番茄根系活力降低，易发病。
番茄黄萎病危害植株后出现慢性枯萎，不像青枯病、枯萎病那样呈急性枯萎。病株下部叶片白天出现枯萎，并由下向上蔓延；植株矮小，果实膨大不充分。黄萎病病菌在土中残存，还可危害茄子、草莓等，应避免与这些作物连作。
防治可在播种和定植前，用２５％多菌灵可湿性粉剂５００倍液或５０％多菌灵可湿性粉剂１０００倍液、５０％甲基托布津可湿性粉剂４００倍液、农抗１２０杀菌剂１００毫克／升、７０％敌克松可湿性粉剂（每平方米５克）等处理苗床或灌根；或每平方米用９８％恶霉灵１克加水３公斤对土壤喷雾。定植后，用５０％多菌灵可湿性粉剂１５００倍液或２５％多菌灵可湿性粉剂７５０倍液灌根。还可将多菌灵或托布津加水做成糊状涂抹病部。用药间隔期７～１０天，连续用药２～３次。
