大多数食用菌极易被绿霉所污染，污染后严重影响其外观和质量，甚至造成蘑菇菌丝体或子实体生长不良或死亡。现将其防治方法简谈如下：
（1）播种后要及时检查菌种块，发现有绿色菌落，立即挖除并再次消毒，然后补上新种块。
（2）生产环境不清洁，空气中的病菌孢子会乘机而侵。生产中的菌丝愈合及定植或采菇时，应及时、适时（用药）、彻底做好清境工作。
（3）病菌孢子喜欢高温、高湿环境，尽量选择低温、干燥的季节栽培。挖瓶压块后，可用塑料薄膜覆盖，通气适时、适量，注意降湿（相对湿度85%以下）、降温（20℃以下）。
(4)生产中严防甲醛过量施用，否则，甲醛变成甲酸，形成病菌喜欢的酸性环境。室内撒施石灰粉，创造病菌不易成活的碱性环境。（一般pH>7）。
（5）多雨年份或季节，要特别注意通风降湿，勤翻堆。堆垛面积和距离应适当加大，减少感染。
（6）后期塑料薄膜不易揭开过早。以免愈合中的菌块受侵。
（7）菌块出现绿霉后，应及时用40%多·硫悬浮剂或50%多菌灵可湿性粉剂800倍液擦洗。
（8）采菇时，除了做好消毒工作外，还应注意轻扯，以免菇根受伤害，从而加大病菌感染机会。
（9）病菌孢子靠气流传播，采菇后，及时把死菇、老根挑除干净，摧毁病菌的繁殖生长基地。
