水稻旱育秧苗床虽不易烂秧，但最易发生立枯病死苗，轻者20%－30%，重者50% 以上，采取以下措施，可以有效地防治立枯病。
１、对土壤进行调酸处理：中性和碱性土壤，在播种前要进行调酸处理，把pH值调至6以下，可以有效地控制立枯病的浸染为害。 具体做法是：在播种前对土壤进行测试，pH值为6－6.5的，每平方米施用专用调酸肥30－40g，pH值为6.5－7的施40－50g，于播种前一天施入，并与土壤充分混合，使土壤pH值调至4.5－5.5之间。
２、对苗床土壤消毒，避免土壤传病：经过调酸处理后苗床，每平方米用70% 的敌克松2g，稀释成600倍水溶液，均匀地喷洒在苗床上，如遇晴天， 敌克松用量减半，否则会烧种。
３、播种不要过密，以免产生弱苗：掌握播种量，是培育旱育秧壮苗的关键一环。一般育50－55天大苗秧，每平方米播种量为20－25g。如播种过密，秧苗瘦长， 抗性减弱，易感立枯病，而壮苗则抗性较强，不易感染立枯病。
４、药剂防治：1叶1心至2叶1心期，最易发生立枯病浸染死苗，可用敌克松600 倍液或立枯灵500倍液进行叶面喷雾，隔5－7天再喷1次，连喷2次， 特别是敌克松对防治立枯病有特效。
５、克服低温， 以免诱发立枯病：早稻播种至出苗以保温为主， 膜内温度保持在30－32℃；1叶1心时以控温控湿为主，膜内温度保持在25℃；2叶1心时，晴天上午10时至下午4时半开膜，阴天中午开膜1－2小时，雨天打开膜换气， 但膜内温度不能低于12℃，否则易诱发立枯病，到3叶1心时揭膜。
