近几年无公害蔬菜发展较快，尤其在各类农业示范园区发展势头更加迅猛，极大地丰富了城乡居民的菜篮子。但在生产中病虫害防治方面存在技术不过关、防治不及时、防治方法不科学的问题，直接影响经济效益。滥用化学农药不但加大投入成本，还造成农药残留过多、污染严重的现象，影响人们的身体健康。因此正确掌握菜椒病虫害防治技术生产出无公害产品，才能取得较好的经济效益。
一、播种前至播种期的防治
1.调整种植结构，合理轮作倒茬。避免与瓜类、茄果类蔬菜连作，可与十字花科甘蓝、大白菜；百合科的大葱、大蒜等实行三年以上轮作。
2.选用抗病品种。如海椒2号、中椒4号、中椒5号、中椒6号、中椒7号、中椒8号、甜椒3号、甜椒4号、甜椒6号、汁椒一号、汁椒九号、丰椒一号、都椒1号、津椒8号、早熟一号等。
3.苗床消毒。可用50%多菌灵1∶100毒土1.2千克／平方米撒施或用75%甲基托布津10克／平方米加少量土混匀撒施或每平方米用绿亨1号1克对水300倍，在播种前或播种后均匀喷洒于床内或将绿亨1号1克对过筛细土15-20千克，配成毒土，将1/3的毒土撒在苗床内，余下2/3的毒土播种后盖种。
4.药剂拌种。每1千克种子用绿亨1号1-1.5克与50%福美双可湿性粉剂3-4克或绿亨3号8-10克拌种，拌后随后播种。
5.药剂浸种。用10%磷酸三钠液浸种30分钟或100倍福尔马林浸种30分钟或50%多菌灵500倍液浸种2小时。
二、播种至定植期
1.选用75%甲基托布津600-800倍液或75%百菌清1000倍液防治立枯病；72.2%普力克水剂5-7.5毫升／平方米喷苗床防治猝倒病，兼治早疫病、炭疽病等。
2.在苗床期每667平方米用仵氏辣椒粉两袋或克病灵500-800倍液、或病毒a可湿性粉剂400倍液喷雾，防治病毒病。每隔7天喷一遍，连喷3次。均能收到良好效果。
三、定植至结果期
用50%避蚜雾或10%吡虫啉5克／（亩）对水40千克防治蚜虫，兼治棉铃虫；交替使用dt乳剂400毫升／（亩），或用20亿pib/毫升棉铃虫核型多角体病毒悬浮剂50～60毫升／（亩）防治棉铃虫，兼治烟青虫，蚜虫。在枯萎病发病前和发病初期用绿亨1号3000倍液灌根，或绿亨2号600倍液或绿亨8号1500～2000倍液，或青椒安2号500倍液喷雾或灌根，每隔7～10天用1次，连续2～3次，兼治其它病害。对病毒病可用植病灵1000～1500倍液，或用病毒a600倍液，或用2%中南霉素300～400毫升／（亩）喷雾，效果显著。
四、结果期
1.病害的防治。在发病初期田间喷药，用75％甲基托布津600-800倍液、或40%多菌灵400～600倍液、或炭疽福美600倍液，防治炭疽病、白粉病、疫病等；用72%农用链霉素20克／（亩）、或25%青枯灵可湿性粉剂，防治细菌性疮痂病：用72%普力克水剂、或30%恶毒灵水剂800倍液、或70%代森锰锌可湿性粉剂500倍液，防治枯萎病、灰霉病；用20%病毒a或1.5%植病灵可湿性粉剂500倍液防治病毒病；用72%克露可湿性粉剂600～800倍液、或77%可杀得可湿性粉剂500倍液防治晚疫病、绵疫病、绵腐病等；保护地可用5%霜克粉尘剂、或5%霜霉威粉尘剂、或5%百菌清粉尘剂1千克／（亩）喷粉防治多种病害。
2.虫害的防治：①幼虫低龄阶段喷雾：用0.9%阿维菌素3000倍喷雾防治茶黄螨；用10%大功臣可湿性粉剂1000倍防治蚜虫：用2.5%功夫乳油，或10%吡虫啉乳油，或4.5%高效氯氰菊酯乳油1500倍防治蚜虫、棉铃虫、烟青虫、甜菜夜蛾、美洲斑潜蝇。每隔5～7天喷1次，连喷3次。②物理防治：保护地可设置黄板或黄筒诱杀白粉虱、烟粉虱、蚜虫、美洲斑潜蝇等对黄色有趋性的害虫，或复盖银灰色地膜驱避蚜虫。③生物防治：积极保护利用天敌，发现粉虱成虫时，可释放丽蚜小蜂；生物药剂，用1.8%虫螨克浓可溶性水剂，或2%菌毒克（宁南霉素），或72%农用硫酸链霉素可溶性粉剂，或5%卡死克乳油等生物制剂防治病虫等。
大力应用设施栽培技术，提高蔬菜的商品价值地膜覆盖技术，小拱栩、塑料大拥的利用，遮阳网、防虫网覆盖栽培，已被广大的农民所掌握及应用。在条件好的城市还可应用可控温、湿、气的大棚，打破了种菜要看季节气候的传统习惯，其商品价值大大提高。设施栽培还能通过人为控制气候、土壤（基质）条件，减少和预防病虫害的发生，使无公害蔬菜生产成为现实。在棚内种植的菜椒若发现有害虫为害，可人工释放一些天敌控制害虫发生，以减少喷施杀虫剂的次数，使蔬菜产品更安全。
当前在蔬菜生产中病虫害的防治往往只是把重点放在作物发病后或虫害发生后采用药剂防治，农药的用量一年比一年大，毒性越来越高，残留期越来越长。蔬菜的“安全、优质”生产受到一定的制约。因此重新强调农业技术措施在蔬菜生产中的重要意义，能达到事半功倍的作用。
