栽植抗病虫的优良脱毒苗木因地制宜地选用适合当地气候条件、土壤条件的脱毒无病虫害的健壮苗木，可以从根本上减轻病虫害的发生，减少农药的使用次数。此外，有些果树应避免混栽，如苹果、梨、桃不宜混载。
利用栽培管理措施消灭病虫害一是要切实加强果园土肥水管理。通过果园施绿肥减施化学氮肥，增施钾肥和农家肥，合理排灌等增强树势的各种有利的栽培措施，增强树体对轮纹病、斑点落叶病等病害的抵抗能力，恶化螨虫、蚜虫、蚁类的营养条件，减轻剌吸害虫的危害。二是精细修剪。及时剪去病虫枝、枯死枝、内膛过密枝，通过修剪调整树体结构，改善树体通风透光条件，减轻落叶病、蚜虫等的危害。三是严格疏花疏果、套袋，控制病虫害。通过疏花疏果、合理负载，可以平衡和保持健壮的树势，提高树体的抗病虫能力，减轻危害。通过套袋，可以预防病虫的侵入，避免果实与农药的接触。此外，还应采取冬季清园、刮树皮、人工捕捉等技术措施减轻病虫危害。
利用有效物理措施利用病虫对某些物质或条件的强烈趋向习性，采用物理措施集中消灭。如利用糖醋液、黑光灯、黄板、树干束草等诱杀多种害虫。
利用天敌消灭病虫保护和利用害虫天敌，如草蛉、瓢虫、赤眼蜂等害虫天敌。在天敌发生期，严格控制用药种类，不用药或少用药，在果园间种植牧草，以利于天敌繁衍，或人工饲养天敌，消灭害虫。
使用低毒化学农药生产无公害果品过程中禁止使用高毒、高残留农药；限量使用中等毒性农药，如灭扫利、功夫等，1个生长周期内只允许喷药1次；选用低毒、低残留农药。
安全使用化学农药绝大多数农药都有间隔使用期限，要严格按照说明使用，以保证果品中农药无残留，或残留不超标。
