1、精细采收。马水桔采收过早或过迟都会影响它的损耗、腐烂、发病及贮藏寿命，要求在果实充分生长、累积了足够的糖分并且含糖量不再大幅度增加、皮色一般在转黄时采收。采收时应选择晴朗露水已干的午前进行。阴雨天、雾天及露水未干时、中午以后，不宜采收。采收时，不要拉断果柄，必须用果剪剪平果蒂。
采剪的方法是：第一剪剪至离果蒂1厘米处，第二剪剪齐萼片，整齐剪去果柄，避免果柄过长过短，因过长则伤及其他果实，过短又造成果实伤口。树上分级、树下包装，部分人员先采摘一级果，随后用大部分人员采收二级果，其他果另行处理，避免采果、分级、包装时造成机械伤。
2、药剂防腐。采前、采后进行药剂处理是保证果实贮藏质量，减少腐烂的重要措施之一。采收前一周，用50--100ppm的2，4--D喷洒果蒂；也可用1000倍的多菌灵或托布津与50--100ppm的2，4--D混合液全树喷洒，有消灭初期附在果实上的病菌作用，对果实起到防腐的效果。药剂喷射时要仔细，果实部位必须全部喷到。采收后，用200ppm2，4--D和1000倍的托布津或多菌灵混合液浸果，能起到防腐的作用。为了减少病菌的感染，凡装过桔子的箱子都要用0.1%的多菌灵或0.2%托布津喷洒消毒。特别是去年用过的箱子，要清洗干净、晒干，再用托布津或多菌灵喷洒消毒。
3、仓库贮藏。马水桔的常温贮藏库，不需要特殊的设备，一般的民房、普通仓库都可使用，库房宜通风良好，不漏雨，果堆不会受到阳光的照射，并能防止鼠害。库房在果品库前两周，要用硫磺粉(100克/平方米)密封熏蒸24小时，或用4%的漂白粉喷洒，然后通风换气，准备贮藏。初入库时要打开所有的门窗，有利于通风换气和马水桔果实的发汗、散热。
