1、养猪场已越来越不让人参观了。
2、环保部门要求猪场污水排放标准过高。
目前台湾环保部门制订污水排放标准过高，开始时，1987年-1992年要求排放的污水，BoD是400mg／L，5年后即1993--1997年，为BoDl00mg／L，CoD400mg／L，而1998年后到目前的排放标准是BoD80mg/L，CoD250mg/L，虽然是逐步提高与国际接轨，但目前标准仍有些过高。因此，许多猪场为了达到排放标准，采取“下雨就排，不下雨不排”的对策，或者“大雨多排，小雨小排，不下雨不排”的应变方法。用雨水来稀释污水中BOD和COD。
3、减少猪粪尿排出量
台湾许多学者认为：降低猪场粪尿处理的成本办法，首先必须减少处理的粪尿排出量。而粪便的数量，应按猪场年上市肉猪头数和重量平均数来计算的，因此，要减少粪尿排出量主要选择和促进猪生长快，繁殖率高，饲料利用率高的猪种外，还可用下列方法来减少猪粪尿排出量。
(1) 饲料配方接近需要量：可减少N排出10-15％；
(2) 采用高消化率饲料：可减少N排出5％，磷5％；
(3) 利用生长促进剂：可减少N排出5％，磷5％；
(4) 采用低蛋白，补充氨基酸饲料配方；可减少N排出21～25％；
(5) 利用植酸酶增加磷的消化率，可减少磷排出量25～30％：
(6) 采用多阶段饲料配方饲养肉猪，可减少N排出10％。
4、鱼牧结合方法已放弃
用饲料养猪、再用猪粪养鱼。被认为是生态平衡的好方法。而台湾经过多年的实践后，认为这种方法不很可取。据说有一种罗非鱼，很适合用猪粪来饲养而生长，但认为猪粪未经处理，对水质有严重污染。更是猪粪中残留药物和某些重金属盐，如抗生素、磺胺类和铜、砷等元素、会富集鱼体之中，人食用后有害健康、基于上述原因，目前台湾已经彻底放弃鱼牧结合的方法。
5、畜禽的粪便处理是一种付出、很难收回的投资
在台湾许多猪场都采用“三段式”处理粪便的方法 。台湾气候炎热、猪舍和猪身都有用水冲洗，以达到防降温的目的，同时也冲洗粪便，因此用水量很大，而且粪与水在一起，处理量也很大。在处理时，首先必须把其中的固体物分离出来，这是第一阶段的固液分离。目前台湾生产的粪水分离机已到达非常实用的阶段，价格也不贵。第二阶段是采用厌氧发酵，即把液体部分在厌氧池内进行沼气发酵，厌氧发酵池是用耐紫外线曝晒的橡塑布、固定在池壁上，并用池内液体高出接口，达到密封的要求。这种处理方法在广东、广西、福建可以应用。
这种三阶段处理方法，每公斤猪活重，需要台币1.5元,即人民币0.25-0.4元,因此,保护生态环境,排放污水达到环保要求,政府和猪场都要投入资金。
6、沼气发酵只能除去粪水中30-40%的有机物。
台湾人认为，沼气发酵仅仅是利用粪尿转化为能量的一个过程。不能作为粪便处理的全部。因为沼气发酵只能除去粪水中30-40%有机物，还有60-70%有机物仍要处理。沼气产生需要较高环境温度，往往在冬天需要沼气时不产生沼气，而夏天不要沼气时，则沼气很多，以前台湾一个猪场，利用沼气发电，但实践证明是失败的，因为沼气发电需要锅炉、发电机和人工，在经济上不合算。
7、猪场的臭味问题
大陆及台湾省畜禽粪便排放是以BOD和COD为标准的。但有些国家则以氮和磷的数量为标准。特别严格控制磷的排放标准，因为磷不会被分解，而氮则可变成氨（NH4）而挥发。由于氨的挥发而造成猪场的臭味问题。实际上猪场的臭味除氨、甲烷和硫化氢等气体外，还有猪粪中的粪臭素，即一种难以言表的特殊气味。据说猪场的臭味可随风飘至2-3公里外，引起猪场与附近居民的矛盾，所以台湾猪除做好粪便处理工作外，还在逢年过节用小恩小惠办法与周围群众搞好关系。
8、台湾在推广水帘式猪舍
水帘式鸡舍在台湾已应用多年。目前把水帘式通风用于养猪业上，已取得明显效果。据有关资料显示，在台湾用水帘式猪舍饲养大肉猪，生长速度提高25-30%，饲料报酬也大幅度提高。此外，水帘式猪舍用于饲养公猪和配种前后母猪，其公猪精液质量、母猪配种受胎率均有明显提高。因此利用水帘式猪舍饲养公猪和配种前后有明显效果。另外，经测定，水帘式猪舍内的细菌数可以减少至普通猪舍千分之一，而且水帘式猪舍内没有蚊蝇干扰、氨和臭味明显减少。
